Før i tiden troede man at jorden ikke ændrede sig, men på vulkanerne i sán tiago, det er en af kap verde-øerne ud for Afrika, så Darwin et hvidt lag, der løb tværs gennem en klippeskrænkt, 15 meter over havets overflade. Darwin begyndte at undersøge laget nærmere, han fandt koraller og muslingeskaller i laget. Dette lag måtte altså havde været havbund engang for mange år siden, så øen måtte have hævet sig langsomt op fra havets bund.
Men mod slutningen af rejsen ankom skibet til Galápagosøerne. Darwin var på øerne fra d.15.september til d.22.oktober 1835. men det han så der skulle komme til at underbygge hans udviklingsteorier. I hans bog har Darwin kort beskrevet at vi nedstammer fra aberne, det medførte en stor debat og satiriske tegninger.
Det første indtryk han fik, var ikke positivt. Øerne bestod af bare vulkanklipper, og det lugtede forfærdeligt. Darwin beskrev det som en slags ”forhave til helvede”. Men efter et par dage så han det usædvanlige planteliv, det var helt anderledes. Han så Elefantskilpadder, havleguaner og de meget specielle småfugle – finker. Elefantskildpadden var fejlagtigt blevet kaldt galápagos af de først spanske besøgende, deraf navnet på øen. Darwin opdagede at skildpadden hørte til en art der ikke var kendt andre steder i verden. Fordi den ikke var set andre steder i verden og det måtte være en ny art. Havleguanerne svømmede i havet og levede af alger i modsætning til deres slægtninge i Sydamerika, som er rovdyr. Men de dyr der fik størst betydning for Darwins teori var de små finker. Finker er en gruppe af spurvefugle.
Det er gratis at oprette en konto