Proteiner og enzymer: opbygning og funktion

Opbygningen af et protein: I cellerne findes der store mængder af proteiner, som har forskellige funktioner. Proteiner er opbygget af lange kæder af aminosyrer. En aminosyre består af en aminogruppe (H2N), en carboxylsyregruppe (O, C, OH), og et radikal (R). Der findes 20 forskellige radikalgrupper, og dermed 20 forskellige aminosyrer. Aminosyrer er koblet sammen via peptidbindinger. Fx kan to aminosyrer reagerer kemisk med hinanden, når de binder sig sammen, peptidbindinger. Det er en kovalentbinding mellem c-atomet i carboxylsyregruppe i den ene aminosyre og N-atomet i aminogruppen i den anden aminosyre. Når en petidbinding dannes, fjernes der atomer fra de to aminosyrer; der fjernes O og et H fra den ene aminosyres carboxylsyregruppe, og der fjernes et H fra den anden aminosyres aminogruppe. De to H’er og det ene O danner tilsammen vand. To aminosyrer der er bundet sammen af en peptidbinding, kaldes et dipeptid. En kemisk reaktion hvor to mindre molekyler bindes sammen til et større (og der fraspaltes vand), kaldes en kondensationsreaktion. Dannelsen af peptidbindinger er er et eksempel på kodensationsreaktion. Hvis et molekyle består af tre sammenbundne aminosyrer, kalder man det et tripeptid, og hvis der er mange kaldes det et polypeptid. Menneskeceller kan kun producere 12 af de 20 aminosyrer. De resterende 8 skal tilføres med kosten og kaldes essentielle aminosyrer. Når man skal beskrive proteiners rumlige opbygning, og dermed også enzymers, gøres det på fire strukturniveauer: Primærstrukturen fortæller om antallet af aminosyrer, og hvilke, og rækkefælgen. Sekundærstrukturen fortæller om proteinets foldning. Aminosyrerne: perler på en snor. Andre dele af proteinerne er spiralfoldede (alfa-helix) eller udformet som bølgende plader (b-foldeblad). De fastholdes af hydrogenbindinger. Tertiærstrukturen er den overordnede foldning af proteinet. Kvarternærstrukturen beskriver den samlede struktur af proteiner